La visita de fiscalización de la DIAN es un medio de prueba del procedimiento tributario: la inspección tributaria se decreta mediante auto notificado, que indica los hechos materia de la prueba y los funcionarios comisionados, y de ella se levanta un acta (Estatuto Tributario, art. 779); la inspección contable también termina en acta, de la que se entrega copia una vez cerrada y suscrita (art. 782). El registro y allanamiento penal, en cambio, es una diligencia de investigación del proceso penal regulado por la Ley 906 de 2004: el fiscal que dirige la investigación puede ordenarlo, para obtener elementos materiales probatorios y evidencia física, y lo realiza la policía judicial (art. 219). Solo procede con motivos razonablemente fundados de que el delito investigado tiene como probable autor o partícipe al propietario o tenedor del bien, o de que allí están los instrumentos o el producto del delito (art. 220), respaldados al menos en un informe de policía judicial, una declaración jurada o elementos materiales probatorios (art. 221). La orden debe determinar los lugares que se van a registrar, y no se permiten órdenes indiscriminadas o que señalen el bien de forma global (art. 222); se debe diligenciar dentro de 30 días en la indagación o 15 después de la imputación, con una sola prórroga (art. 224).
Durante la diligencia la policía judicial debe limitarse a los lugares autorizados, procurar la menor restricción posible de los derechos y levantar un acta con los lugares registrados, los objetos incautados y las personas capturadas; el acta se lee a los afectados, quienes pueden pedir que se consignen sus discrepancias, y si se niegan a firmar el funcionario deja constancia bajo juramento (art. 225). Si el procedimiento ocurre entre las 6:00 p. m. y las 6:00 a. m. debe acompañarlo la Procuraduría, pero no se suspende por su ausencia (art. 225, par.). Los propietarios o tenedores tienen derecho a copia del acta (art. 227). Después la policía judicial informa al fiscal y le remite el inventario (art. 228), y el allanamiento queda sujeto a un control de legalidad posterior ante el juez de control de garantías, dentro de los términos legales; la empresa debe actuar de inmediato, con un enfoque tributario y de la DIAN. Si la orden carece de requisitos esenciales, la diligencia es inválida y la evidencia que dependa de ella se excluye (art. 232). No son registrables las comunicaciones escritas entre el indiciado y sus abogados ni los archivos con información confidencial de esa relación (art. 223). Aunque la Fiscalía actúe por un posible delito tributario, los tipos de los artículos 434A y 434B del Código Penal exigen que el monto esté “definido por liquidación oficial”; por eso un registro en esa fase suele ser un indicio de que se investigan otros tipos penales, y conviene que un abogado lea la orden.